let faidx ~(run_with:Machine.t) fasta =   let open KEDSL in   let samtools = Machine.get_tool run_with Machine.Tool.Default.samtools in   let src = fasta#product#path in   let dest = sprintf "%s.%s" src "fai" in   let program =     Program.(Machine.Tool.(init samtools) && exec ["samtools"; "faidx"; src]) in   let name = sprintf "samtools-faidx-%s" Filename.(basename src) in   let make = Machine.run_program ~name run_with program in   let host = Machine.(as_host run_with) in   workflow_node     (single_file dest ~host) ~name ~make     ~edges:[       depends_on fasta;       depends_on Machine.Tool.(ensure samtools);       on_failure_activate (Remove.file ~run_with dest);     ]