Biokepi API : Biokepi_run_environment.Region.parse

let parse_samtools s =
  match String.split ~on:(`Character ':') s with
  | [] -> assert false
  | [one] -> `Chromosome one
  | [one; two] ->
    begin match String.split ~on:(`Character '-') two with
    | [left; right] ->
      begin match Int.of_string left, Int.of_string right with
      | Some b, Some e -> `Chromosome_interval (one, b, e)
      | _ -> failwithf "Cannot parse %S into 2 loci" two
      end
    | _ -> failwithf "Not one '-' in %S" two
    end
  | _ -> failwithf "Not one or zero ':' in %S" s