|
name : string ; |
|
vaccine_peptide_length : int ; |
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padding_around_mutation : int ; |
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max_vaccine_peptides_per_mutation : int ; |
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max_mutations_in_report : int ; |
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min_mapping_quality : int ; |
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min_variant_sequence_coverage : int ; |
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min_alt_rna_reads : int ; |
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include_mismatches_after_variant : bool ; |
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use_duplicate_reads : bool ; |
|
drop_secondary_alignments : bool ; |
|
mhc_epitope_lengths : int list ; |
|
reviewers : string list option ; |
|
final_reviewer : string option ; |
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xlsx_report : bool ; |
|
pdf_report : bool ; |
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ascii_report : bool ; |
|
parameters : (string * string) list ; |
}