Module Biokepi_run_environment.Reference_genome.Specification (.ml)

module Specification: sig .. end

module Location: sig .. end
type t = {
   name : string;
   ensembl : int;
   species : string;
   metadata : string option;
   fasta : Location.t;
   dbsnp : Location.t option;
   known_indels : Location.t option;
   cosmic : Location.t option;
   exome_gtf : Location.t option;
   cdna : Location.t option;
   whess : Location.t option;
   major_contigs : string list option;
   snpeff_name : string option;
}
val create : ?metadata:string ->
fasta:Location.t ->
ensembl:int ->
species:string ->
?dbsnp:Location.t ->
?known_indels:Location.t ->
?cosmic:Location.t ->
?exome_gtf:Location.t ->
?cdna:Location.t ->
?whess:Location.t ->
?major_contigs:string list ->
?snpeff_name:string ->
string -> t
module Default: sig .. end